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JDownloader es una aplicación en Java que permite agilizar y administrar descargas, no solo las comunes, sino también descargas de sitios como RapidShare, MegaUpload entre otros sitios de hosting de archivos. Lo interesante es que este administrador de descargas puede ser utilizado por usuarios de estos sitios que tiene cuenta premium (de paga), así como también, por usuarios que usan estos sitios gratis.

Algunas características de JDownloader son: reconocimiento de captcha, descargas simultaneas del mismo archivo(multi-part), hacer trampa en los tiempos de espera,  re-conección automática, descargas programadas, etc.

Para Instalarlo puedes ejecutar estos comandos en una terminal:

sudo add-apt-repository ppa:jd-team/jdownloader
sudo aptitude update
sudo apt-get install jdownloader

Enlaces: Página web de JDownloader | webupd8.org: Install JDownloader Via PPA Repository [Ubuntu]